Metagenomik ist definiert als die direkte genetische Analyse von Genomen, die in einer Umweltprobe enth alten sind Das Feld begann zunächst mit der Klonierung von Umwelt-DNA, gefolgt von funktionellem Expressionsscreening [1], und wurde dann schnell durch direkte zufällige Shotgun-Sequenzierung von Umwelt-DNA ergänzt [2, 3].
Was ist der Prozess der Metagenomik?
Metagenomik beinh altet die Gewinnung von DNA von allen Mikroorganismen innerhalb einer Gemeinschaft, ohne notwendigerweise alle beteiligten Arten zu identifizieren. Nachdem die Gene sequenziert und mit identifizierten Sequenzen verglichen wurden, können die Funktionen dieser Gene bestimmt werden.
Welche Technik wird in der Metagenomik verwendet?
Eine Probe der mikrobiellen Gemeinschaft wird aus Meerwasser, Sedimenten, Wirtstieren oder anderen marinen Lebensräumen entnommen. Die gesammelten Zellen werden dann lysiert und DNA wird aus ihrem Lysat extrahiert. Die Technik, die Metagenomik ermöglicht, ist die Shotgun-Sequenzierung, die zufällige DNA-Regionen ungezielt sequenziert.
Was sind die 3 Schritte einer Metagenomik-Studie?
Schritte und Prozess der Metagenomik:
- Probensammlung:
- DNA-Extraktion:
- Probenvorbereitung:
- Probenanalyse:
Wie wird funktionelle Metagenomik durchgeführt?
Funktionelle Metagenomik umfasst die Isolierung von DNA aus mikrobiellen Gemeinschaften, um die Funktionen codierter Proteine zu untersuchen. Es beinh altet das Klonen von DNA-Fragmenten, die Expression von Genen in einem Ersatzwirt und das Screening auf enzymatische Aktivitäten.
