BLAST ist ein Computeralgorithmus, der online auf der Website des National Center for Biotechnology Information (NCBI) sowie auf vielen anderen Websites zur Verfügung steht. BLAST kann eine abgefragte DNA-Sequenz schnell mit einer Datenbank von Sequenzen abgleichen und vergleichen, was es zu einem entscheidenden Werkzeug in der laufenden Genomforschung macht.
Ist BLAST eine primäre Datenbank?
BLAST ist die am weitesten verbreitete Software in der bioinformatischen Forschung. Seine Hauptfunktion besteht darin, eine interessierende Sequenz, die Abfragesequenz, mit Sequenzen in einer großen Datenbank zu vergleichen. BLAST meldet dann die besten Übereinstimmungen oder "Treffer", die in der Datenbank gefunden wurden. Dieses einfache Programm hat zwei Hauptanwendungen.
Ist NCBI eine Datenbank?
Das NCBI beherbergt eine Reihe von Datenbanken, die für Biotechnologie und Biomedizin relevant sind und ist eine wichtige Ressource für Bioinformatik-Tools und -Dienste. Zu den wichtigsten Datenbanken gehören die GenBank für DNA-Sequenzen und PubMed, eine bibliografische Datenbank für biomedizinische Literatur. Andere Datenbanken umfassen die NCBI Epigenomics-Datenbank.
Wird BLAST nur in NCBI-Datenbanken eingesetzt?
BLAST ist im Internet auf der NCBI-Website verfügbar. Je nach Abfragesequenz und Zieldatenbank sind verschiedene Arten von BLASTs verfügbar.
Wie funktioniert die BLAST-Datenbank?
Wie funktioniert BLAST? BLAST identifiziert homologe Sequenzen unter Verwendung einer heuristischen Methode, die anfänglich kurze Übereinstimmungen zwischen zwei Sequenzen findet; somit berücksichtigt das Verfahren nicht den gesamten Sequenzraum. Nach der ersten Übereinstimmung versucht BLAST, lokale Ausrichtungen von diesen anfänglichen Übereinstimmungen zu starten.
